近日，中原研究中心“新翼”青创计划李勇副研究员新发现了70.6%的新变异和3289个基因，揭示了全球桃的亲缘关系和进化路线，并开发了基因定位新策略GWASPV，实现了农艺性状基因和功能变异的“一步定位”，显著提高了木本果树基因发掘的效率，为桃分子育种提供了支撑。相关成果以研究长文的形式发表在《 Molecular Plant （分子植物）》。

研究利用1020份桃种质的基因组重测序数据，分别检测了SNP、indel、SV、CNV、TIP、PAV等目前已知的所有DNA变异类型，构建了首个完整变异组图谱，其中70.6%的变异为首次鉴定；构建了1020份种质的泛基因组图谱,发现了3289个参考基因组中没有的新基因；不同类群基因数目比较表明桃驯化和进化过程中基因数目显著增加,与其他植物不同,说明桃驯化过程中存在明显的基因渐渗；基于完整变异组图谱，重构了全球桃传播进化路线，发现扁桃参与了山桃的形成，栽培桃最可能的直接野生祖先是光核桃，甘肃桃参与了新疆桃的形成。提出了基于完整变异组的基因定位新策略GWASPV，在40个农艺性状、51个环境性状和1857个代谢物性状的基因定位中应用，新发现了超过2000个性状关联变异，实现了很多性状的关键基因和功能变异的一步鉴定，显著提高了基因定位的效率。

Molecular Plant,2025,ISSN 1674-2052,

DOI:https://doi.org/10.1016/j.molp.2025.04.009. IF=17.1

原文链接：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205225001352